蚊子主要的危害是传播疾病。据研究，蚊子传播的疾病达80多种之多。在地球上，再没有哪种动物比蚊子对人类有更大的危害。大部分品种的蚊子还会传染病毒性的疾病，包括黄热病、登革热、日本脑炎、圣路易脑炎、多发性关节炎、裂谷热、契昆根亚热及西尼罗河热。幸运的是，艾滋病不会借由蚊子叮咬而传染。

    蚊子咬吸了含有本病毒的人或动物的血液后，经过一个相当时期就具有了感染性，再叮咬没有免疫力的人时可以使被咬者发病。传染这种病的蚊子叫库蚊和伊蚊。防治本病的发生与流行除注射疫苗、防治传染外，必须大力进行灭蚊，消灭传播者。此外，库蚊和按蚊还传播丝虫病（象皮肿）。